Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSM3P62310 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LSM3P62310 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSM3P62310 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LSM3P62310 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSM3P62310 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSM3P62310 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSM3P62310 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSM3P62310 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSM3P62310 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSM3P62310 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSM3P62310 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSM3P62310 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSM3P62310 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSM3P62310 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSM3P62310 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSM3P62310 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSM3P62310 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSM3P62310 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSM3P62310 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSM3P62310 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSM3P62310 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSM3P62310 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSM3P62310 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSM3P62310 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSM3P62310 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSM3P62310 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSM3P62310 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSM3P62310 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSM3P62310 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LSM3P62310 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LSM3P62310 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LSM3P62310 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LSM3P62310 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LSM3P62310 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LSM3P62310 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LSM3P62310 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LSM3P62310 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LSM3P62310 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LSM3P62310 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LSM3P62310 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LSM3P62310 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LSM3P62310 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LSM3P62310 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LSM3P62310 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LSM3P62310 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LSM3P62310 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms