Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms