Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RAB5BP61020 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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RAB5BP61020 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RAB5BP61020 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RAB5BP61020 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB5BP61020 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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