Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms