Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms