Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ELLP55199 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ELLP55199 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELLP55199 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELLP55199 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELLP55199 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELLP55199 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELLP55199 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELLP55199 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELLP55199 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELLP55199 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELLP55199 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELLP55199 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELLP55199 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELLP55199 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELLP55199 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELLP55199 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELLP55199 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELLP55199 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELLP55199 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELLP55199 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELLP55199 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELLP55199 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELLP55199 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELLP55199 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELLP55199 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms