Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAPAP54920 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAPAP54920 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAPAP54920 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAPAP54920 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAPAP54920 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAPAP54920 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAPAP54920 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAPAP54920 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAPAP54920 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAPAP54920 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAPAP54920 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAPAP54920 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NAPAP54920 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAPAP54920 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAPAP54920 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAPAP54920 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAPAP54920 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAPAP54920 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAPAP54920 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAPAP54920 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAPAP54920 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAPAP54920 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAPAP54920 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAPAP54920 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAPAP54920 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAPAP54920 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAPAP54920 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAPAP54920 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NAPAP54920 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAPAP54920 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAPAP54920 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAPAP54920 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAPAP54920 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAPAP54920 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAPAP54920 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAPAP54920 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAPAP54920 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAPAP54920 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAPAP54920 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAPAP54920 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAPAP54920 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAPAP54920 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAPAP54920 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAPAP54920 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAPAP54920 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAPAP54920 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAPAP54920 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAPAP54920 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAPAP54920 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAPAP54920 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAPAP54920 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAPAP54920 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAPAP54920 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAPAP54920 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAPAP54920 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAPAP54920 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAPAP54920 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAPAP54920 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAPAP54920 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAPAP54920 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NAPAP54920 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NAPAP54920 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAPAP54920 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAPAP54920 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAPAP54920 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAPAP54920 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAPAP54920 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAPAP54920 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAPAP54920 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAPAP54920 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAPAP54920 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAPAP54920 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAPAP54920 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAPAP54920 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAPAP54920 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAPAP54920 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAPAP54920 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAPAP54920 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAPAP54920 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAPAP54920 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAPAP54920 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAPAP54920 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAPAP54920 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAPAP54920 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAPAP54920 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAPAP54920 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAPAP54920 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAPAP54920 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAPAP54920 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAPAP54920 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAPAP54920 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NAPAP54920 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAPAP54920 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAPAP54920 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAPAP54920 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAPAP54920 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAPAP54920 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAPAP54920 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAPAP54920 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms