Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATN1P54259 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATN1P54259 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATN1P54259 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATN1P54259 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATN1P54259 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATN1P54259 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATN1P54259 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATN1P54259 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATN1P54259 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATN1P54259 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATN1P54259 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATN1P54259 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATN1P54259 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATN1P54259 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATN1P54259 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATN1P54259 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATN1P54259 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATN1P54259 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATN1P54259 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATN1P54259 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATN1P54259 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATN1P54259 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATN1P54259 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATN1P54259 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATN1P54259 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATN1P54259 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATN1P54259 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATN1P54259 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATN1P54259 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATN1P54259 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATN1P54259 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATN1P54259 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATN1P54259 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATN1P54259 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATN1P54259 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATN1P54259 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATN1P54259 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATN1P54259 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATN1P54259 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATN1P54259 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATN1P54259 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATN1P54259 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATN1P54259 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATN1P54259 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATN1P54259 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATN1P54259 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATN1P54259 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATN1P54259 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATN1P54259 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATN1P54259 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATN1P54259 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATN1P54259 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATN1P54259 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATN1P54259 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATN1P54259 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATN1P54259 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATN1P54259 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATN1P54259 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATN1P54259 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATN1P54259 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATN1P54259 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATN1P54259 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATN1P54259 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATN1P54259 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATN1P54259 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATN1P54259 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATN1P54259 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATN1P54259 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATN1P54259 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATN1P54259 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATN1P54259 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATN1P54259 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATN1P54259 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATN1P54259 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATN1P54259 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATN1P54259 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATN1P54259 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATN1P54259 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATN1P54259 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATN1P54259 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATN1P54259 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATN1P54259 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATN1P54259 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATN1P54259 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATN1P54259 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATN1P54259 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATN1P54259 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATN1P54259 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATN1P54259 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATN1P54259 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATN1P54259 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATN1P54259 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATN1P54259 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATN1P54259 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATN1P54259 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATN1P54259 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATN1P54259 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATN1P54259 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATN1P54259 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms