Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PGGT1BP53609 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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