Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP98P52948 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP98P52948 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP98P52948 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP98P52948 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP98P52948 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP98P52948 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP98P52948 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP98P52948 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP98P52948 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP98P52948 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP98P52948 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP98P52948 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP98P52948 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP98P52948 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP98P52948 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP98P52948 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP98P52948 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP98P52948 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP98P52948 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP98P52948 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP98P52948 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP98P52948 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP98P52948 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
NUP98P52948 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
NUP98P52948 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP98P52948 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP98P52948 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP98P52948 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP98P52948 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP98P52948 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP98P52948 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP98P52948 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP98P52948 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP98P52948 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP98P52948 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP98P52948 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP98P52948 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP98P52948 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP98P52948 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP98P52948 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP98P52948 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP98P52948 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP98P52948 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP98P52948 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP98P52948 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP98P52948 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP98P52948 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP98P52948 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP98P52948 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP98P52948 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP98P52948 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP98P52948 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP98P52948 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP98P52948 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP98P52948 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP98P52948 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP98P52948 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP98P52948 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP98P52948 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP98P52948 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP98P52948 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP98P52948 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP98P52948 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP98P52948 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP98P52948 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP98P52948 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP98P52948 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP98P52948 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP98P52948 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP98P52948 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP98P52948 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP98P52948 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms