Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms