Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERFP50548 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERFP50548 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERFP50548 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERFP50548 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERFP50548 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERFP50548 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERFP50548 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERFP50548 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERFP50548 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERFP50548 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERFP50548 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERFP50548 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERFP50548 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERFP50548 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERFP50548 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERFP50548 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ERFP50548 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERFP50548 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERFP50548 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERFP50548 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERFP50548 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERFP50548 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERFP50548 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERFP50548 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERFP50548 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERFP50548 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERFP50548 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERFP50548 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERFP50548 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERFP50548 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERFP50548 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERFP50548 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERFP50548 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERFP50548 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERFP50548 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERFP50548 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERFP50548 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERFP50548 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERFP50548 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERFP50548 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERFP50548 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERFP50548 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERFP50548 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERFP50548 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERFP50548 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERFP50548 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERFP50548 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERFP50548 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERFP50548 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERFP50548 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERFP50548 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ERFP50548 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERFP50548 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERFP50548 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERFP50548 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERFP50548 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERFP50548 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERFP50548 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERFP50548 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERFP50548 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERFP50548 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERFP50548 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERFP50548 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERFP50548 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERFP50548 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERFP50548 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERFP50548 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERFP50548 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERFP50548 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERFP50548 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERFP50548 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERFP50548 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERFP50548 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERFP50548 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERFP50548 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERFP50548 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERFP50548 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERFP50548 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERFP50548 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERFP50548 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
ERFP50548 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERFP50548 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERFP50548 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERFP50548 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERFP50548 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERFP50548 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERFP50548 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERFP50548 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERFP50548 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERFP50548 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERFP50548 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERFP50548 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERFP50548 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERFP50548 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERFP50548 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms