Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms