Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RARRES1P49788 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms