Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRIM1P49642 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
PRIM1P49642 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms