Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms