Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RECQLP46063 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RECQLP46063 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RECQLP46063 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RECQLP46063 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RECQLP46063 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RECQLP46063 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RECQLP46063 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RECQLP46063 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RECQLP46063 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RECQLP46063 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RECQLP46063 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RECQLP46063 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RECQLP46063 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RECQLP46063 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RECQLP46063 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RECQLP46063 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RECQLP46063 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RECQLP46063 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RECQLP46063 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RECQLP46063 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RECQLP46063 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RECQLP46063 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RECQLP46063 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RECQLP46063 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RECQLP46063 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RECQLP46063 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RECQLP46063 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RECQLP46063 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RECQLP46063 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RECQLP46063 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RECQLP46063 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RECQLP46063 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RECQLP46063 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RECQLP46063 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RECQLP46063 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RECQLP46063 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RECQLP46063 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RECQLP46063 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RECQLP46063 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RECQLP46063 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RECQLP46063 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RECQLP46063 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RECQLP46063 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RECQLP46063 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RECQLP46063 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RECQLP46063 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RECQLP46063 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RECQLP46063 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RECQLP46063 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RECQLP46063 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RECQLP46063 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RECQLP46063 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RECQLP46063 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RECQLP46063 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RECQLP46063 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RECQLP46063 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RECQLP46063 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RECQLP46063 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RECQLP46063 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RECQLP46063 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RECQLP46063 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RECQLP46063 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RECQLP46063 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RECQLP46063 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RECQLP46063 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RECQLP46063 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RECQLP46063 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RECQLP46063 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RECQLP46063 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RECQLP46063 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RECQLP46063 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RECQLP46063 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RECQLP46063 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RECQLP46063 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RECQLP46063 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RECQLP46063 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RECQLP46063 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RECQLP46063 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RECQLP46063 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RECQLP46063 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RECQLP46063 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RECQLP46063 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RECQLP46063 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RECQLP46063 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RECQLP46063 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RECQLP46063 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RECQLP46063 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RECQLP46063 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RECQLP46063 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RECQLP46063 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RECQLP46063 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RECQLP46063 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RECQLP46063 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RECQLP46063 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RECQLP46063 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RECQLP46063 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RECQLP46063 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RECQLP46063 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RECQLP46063 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
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