Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRATP43155 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRATP43155 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRATP43155 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRATP43155 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CRATP43155 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRATP43155 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRATP43155 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRATP43155 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRATP43155 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRATP43155 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRATP43155 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRATP43155 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRATP43155 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRATP43155 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRATP43155 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRATP43155 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRATP43155 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRATP43155 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRATP43155 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRATP43155 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRATP43155 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRATP43155 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRATP43155 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CRATP43155 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRATP43155 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRATP43155 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRATP43155 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRATP43155 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRATP43155 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CRATP43155 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRATP43155 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRATP43155 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRATP43155 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRATP43155 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRATP43155 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRATP43155 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRATP43155 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRATP43155 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRATP43155 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRATP43155 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRATP43155 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRATP43155 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRATP43155 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRATP43155 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRATP43155 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRATP43155 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRATP43155 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms