Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA2P42765 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA2P42765 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms