Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDH1P40925 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDH1P40925 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDH1P40925 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDH1P40925 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDH1P40925 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDH1P40925 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDH1P40925 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDH1P40925 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDH1P40925 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDH1P40925 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDH1P40925 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MDH1P40925 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDH1P40925 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDH1P40925 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDH1P40925 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDH1P40925 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDH1P40925 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDH1P40925 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDH1P40925 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDH1P40925 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDH1P40925 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDH1P40925 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDH1P40925 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDH1P40925 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDH1P40925 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDH1P40925 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDH1P40925 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDH1P40925 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDH1P40925 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MDH1P40925 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
MDH1P40925 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MDH1P40925 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDH1P40925 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDH1P40925 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDH1P40925 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDH1P40925 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDH1P40925 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDH1P40925 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDH1P40925 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDH1P40925 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDH1P40925 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDH1P40925 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDH1P40925 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDH1P40925 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDH1P40925 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDH1P40925 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDH1P40925 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDH1P40925 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDH1P40925 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDH1P40925 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDH1P40925 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MDH1P40925 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDH1P40925 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDH1P40925 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MDH1P40925 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MDH1P40925 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDH1P40925 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDH1P40925 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDH1P40925 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDH1P40925 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDH1P40925 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDH1P40925 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDH1P40925 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDH1P40925 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDH1P40925 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDH1P40925 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDH1P40925 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDH1P40925 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDH1P40925 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MDH1P40925 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDH1P40925 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDH1P40925 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDH1P40925 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDH1P40925 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDH1P40925 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDH1P40925 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDH1P40925 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDH1P40925 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDH1P40925 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDH1P40925 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDH1P40925 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDH1P40925 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDH1P40925 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDH1P40925 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MDH1P40925 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDH1P40925 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDH1P40925 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDH1P40925 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDH1P40925 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDH1P40925 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDH1P40925 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDH1P40925 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDH1P40925 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDH1P40925 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDH1P40925 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDH1P40925 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDH1P40925 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDH1P40925 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDH1P40925 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms