Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBRP36941 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBRP36941 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBRP36941 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBRP36941 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBRP36941 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBRP36941 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBRP36941 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBRP36941 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBRP36941 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBRP36941 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBRP36941 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBRP36941 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBRP36941 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBRP36941 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBRP36941 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBRP36941 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBRP36941 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBRP36941 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBRP36941 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBRP36941 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBRP36941 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBRP36941 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBRP36941 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBRP36941 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBRP36941 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBRP36941 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBRP36941 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBRP36941 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBRP36941 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBRP36941 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBRP36941 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBRP36941 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBRP36941 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBRP36941 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBRP36941 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBRP36941 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBRP36941 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBRP36941 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBRP36941 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBRP36941 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBRP36941 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBRP36941 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBRP36941 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBRP36941 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBRP36941 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBRP36941 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBRP36941 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBRP36941 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBRP36941 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBRP36941 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBRP36941 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBRP36941 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBRP36941 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBRP36941 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBRP36941 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBRP36941 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBRP36941 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBRP36941 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBRP36941 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBRP36941 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBRP36941 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBRP36941 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBRP36941 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBRP36941 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBRP36941 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBRP36941 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBRP36941 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBRP36941 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBRP36941 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBRP36941 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBRP36941 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBRP36941 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBRP36941 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBRP36941 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBRP36941 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBRP36941 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBRP36941 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBRP36941 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBRP36941 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBRP36941 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBRP36941 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBRP36941 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBRP36941 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBRP36941 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBRP36941 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBRP36941 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBRP36941 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBRP36941 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBRP36941 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBRP36941 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBRP36941 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBRP36941 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBRP36941 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBRP36941 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBRP36941 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBRP36941 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBRP36941 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBRP36941 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTBRP36941 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms