Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACVR1BP36896 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms