Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms