Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN2P35609 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms