Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPS1P31327 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPS1P31327 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPS1P31327 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CPS1P31327 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPS1P31327 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPS1P31327 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPS1P31327 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPS1P31327 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPS1P31327 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPS1P31327 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPS1P31327 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPS1P31327 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPS1P31327 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPS1P31327 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPS1P31327 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPS1P31327 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPS1P31327 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPS1P31327 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPS1P31327 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPS1P31327 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPS1P31327 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPS1P31327 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPS1P31327 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPS1P31327 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPS1P31327 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CPS1P31327 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPS1P31327 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPS1P31327 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPS1P31327 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPS1P31327 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPS1P31327 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPS1P31327 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPS1P31327 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPS1P31327 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPS1P31327 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPS1P31327 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPS1P31327 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CPS1P31327 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CPS1P31327 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CPS1P31327 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CPS1P31327 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CPS1P31327 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CPS1P31327 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CPS1P31327 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CPS1P31327 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CPS1P31327 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CPS1P31327 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CPS1P31327 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CPS1P31327 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CPS1P31327 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CPS1P31327 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CPS1P31327 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CPS1P31327 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CPS1P31327 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CPS1P31327 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPS1P31327 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPS1P31327 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPS1P31327 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPS1P31327 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPS1P31327 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPS1P31327 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPS1P31327 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPS1P31327 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPS1P31327 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPS1P31327 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPS1P31327 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPS1P31327 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPS1P31327 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPS1P31327 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPS1P31327 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CPS1P31327 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPS1P31327 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPS1P31327 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPS1P31327 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPS1P31327 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPS1P31327 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPS1P31327 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CPS1P31327 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPS1P31327 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPS1P31327 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPS1P31327 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPS1P31327 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPS1P31327 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPS1P31327 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPS1P31327 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPS1P31327 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CPS1P31327 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CPS1P31327 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CPS1P31327 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CPS1P31327 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CPS1P31327 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CPS1P31327 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CPS1P31327 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CPS1P31327 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CPS1P31327 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPS1P31327 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPS1P31327 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPS1P31327 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms