Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPOP30536 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPOP30536 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPOP30536 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPOP30536 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPOP30536 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPOP30536 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPOP30536 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms