Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND3P30281 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND3P30281 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND3P30281 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND3P30281 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND3P30281 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCND3P30281 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND3P30281 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND3P30281 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND3P30281 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND3P30281 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND3P30281 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND3P30281 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND3P30281 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND3P30281 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND3P30281 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND3P30281 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND3P30281 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND3P30281 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND3P30281 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND3P30281 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND3P30281 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND3P30281 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND3P30281 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND3P30281 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND3P30281 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCND3P30281 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND3P30281 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND3P30281 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND3P30281 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND3P30281 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND3P30281 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND3P30281 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND3P30281 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND3P30281 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND3P30281 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND3P30281 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND3P30281 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCND3P30281 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND3P30281 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND3P30281 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND3P30281 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND3P30281 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND3P30281 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND3P30281 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND3P30281 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND3P30281 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND3P30281 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND3P30281 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND3P30281 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND3P30281 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCND3P30281 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCND3P30281 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND3P30281 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND3P30281 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND3P30281 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND3P30281 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND3P30281 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND3P30281 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND3P30281 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND3P30281 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND3P30281 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND3P30281 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND3P30281 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCND3P30281 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCND3P30281 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCND3P30281 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCND3P30281 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCND3P30281 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCND3P30281 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCND3P30281 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCND3P30281 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCND3P30281 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCND3P30281 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCND3P30281 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms