Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTGFP29279 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTGFP29279 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTGFP29279 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTGFP29279 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTGFP29279 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTGFP29279 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTGFP29279 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTGFP29279 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTGFP29279 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTGFP29279 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTGFP29279 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTGFP29279 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTGFP29279 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTGFP29279 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTGFP29279 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTGFP29279 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTGFP29279 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTGFP29279 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTGFP29279 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTGFP29279 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTGFP29279 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTGFP29279 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTGFP29279 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTGFP29279 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTGFP29279 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTGFP29279 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTGFP29279 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTGFP29279 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTGFP29279 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTGFP29279 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTGFP29279 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTGFP29279 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTGFP29279 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTGFP29279 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTGFP29279 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTGFP29279 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTGFP29279 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTGFP29279 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTGFP29279 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTGFP29279 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTGFP29279 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTGFP29279 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTGFP29279 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTGFP29279 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTGFP29279 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTGFP29279 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTGFP29279 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTGFP29279 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTGFP29279 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTGFP29279 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTGFP29279 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTGFP29279 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTGFP29279 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTGFP29279 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTGFP29279 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTGFP29279 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTGFP29279 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTGFP29279 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTGFP29279 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTGFP29279 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTGFP29279 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTGFP29279 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTGFP29279 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTGFP29279 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTGFP29279 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTGFP29279 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTGFP29279 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTGFP29279 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTGFP29279 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTGFP29279 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTGFP29279 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTGFP29279 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTGFP29279 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTGFP29279 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTGFP29279 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTGFP29279 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTGFP29279 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTGFP29279 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTGFP29279 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTGFP29279 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTGFP29279 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTGFP29279 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTGFP29279 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTGFP29279 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTGFP29279 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTGFP29279 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTGFP29279 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTGFP29279 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTGFP29279 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTGFP29279 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTGFP29279 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTGFP29279 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTGFP29279 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTGFP29279 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTGFP29279 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTGFP29279 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTGFP29279 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTGFP29279 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTGFP29279 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms