Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD10P28358 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD10P28358 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms