Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4AP27815 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4AP27815 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4AP27815 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4AP27815 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4AP27815 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4AP27815 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4AP27815 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4AP27815 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4AP27815 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4AP27815 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4AP27815 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4AP27815 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4AP27815 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4AP27815 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4AP27815 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4AP27815 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4AP27815 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4AP27815 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4AP27815 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4AP27815 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
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