Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms