Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GADD45AP24522 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms