Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCSHP23434 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCSHP23434 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCSHP23434 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCSHP23434 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCSHP23434 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCSHP23434 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCSHP23434 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCSHP23434 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCSHP23434 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCSHP23434 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCSHP23434 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCSHP23434 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCSHP23434 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCSHP23434 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCSHP23434 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCSHP23434 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCSHP23434 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCSHP23434 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GCSHP23434 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCSHP23434 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCSHP23434 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GCSHP23434 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GCSHP23434 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GCSHP23434 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCSHP23434 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCSHP23434 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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