Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms