Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms