Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-DPA1P20036 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms