Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCLP19338 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCLP19338 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NCLP19338 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCLP19338 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCLP19338 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCLP19338 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCLP19338 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCLP19338 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCLP19338 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCLP19338 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCLP19338 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCLP19338 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCLP19338 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCLP19338 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCLP19338 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCLP19338 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCLP19338 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCLP19338 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCLP19338 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCLP19338 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCLP19338 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCLP19338 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCLP19338 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCLP19338 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCLP19338 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCLP19338 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCLP19338 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCLP19338 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCLP19338 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NCLP19338 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NCLP19338 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCLP19338 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCLP19338 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCLP19338 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCLP19338 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCLP19338 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCLP19338 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCLP19338 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCLP19338 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCLP19338 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCLP19338 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCLP19338 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCLP19338 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCLP19338 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCLP19338 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCLP19338 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NCLP19338 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCLP19338 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCLP19338 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NCLP19338 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCLP19338 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCLP19338 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCLP19338 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCLP19338 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCLP19338 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NCLP19338 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCLP19338 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCLP19338 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCLP19338 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCLP19338 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCLP19338 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCLP19338 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCLP19338 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCLP19338 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCLP19338 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCLP19338 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCLP19338 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms