Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPI1P17947 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPI1P17947 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPI1P17947 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPI1P17947 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPI1P17947 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPI1P17947 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPI1P17947 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPI1P17947 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPI1P17947 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPI1P17947 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPI1P17947 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPI1P17947 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPI1P17947 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPI1P17947 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPI1P17947 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPI1P17947 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPI1P17947 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPI1P17947 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPI1P17947 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPI1P17947 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPI1P17947 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPI1P17947 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPI1P17947 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPI1P17947 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPI1P17947 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPI1P17947 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPI1P17947 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPI1P17947 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPI1P17947 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPI1P17947 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPI1P17947 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPI1P17947 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPI1P17947 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPI1P17947 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPI1P17947 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPI1P17947 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPI1P17947 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPI1P17947 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPI1P17947 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPI1P17947 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPI1P17947 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms