Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFAP15692 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms