Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF2P15336 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF2P15336 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF2P15336 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF2P15336 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF2P15336 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF2P15336 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF2P15336 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF2P15336 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF2P15336 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF2P15336 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF2P15336 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF2P15336 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF2P15336 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF2P15336 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF2P15336 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF2P15336 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF2P15336 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF2P15336 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF2P15336 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF2P15336 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF2P15336 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF2P15336 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF2P15336 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF2P15336 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF2P15336 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF2P15336 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF2P15336 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF2P15336 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF2P15336 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF2P15336 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF2P15336 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF2P15336 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF2P15336 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF2P15336 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF2P15336 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF2P15336 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF2P15336 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF2P15336 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF2P15336 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF2P15336 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF2P15336 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF2P15336 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF2P15336 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF2P15336 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF2P15336 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF2P15336 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF2P15336 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF2P15336 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF2P15336 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATF2P15336 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATF2P15336 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATF2P15336 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATF2P15336 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms