Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms