Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP1A3P13637 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A3P13637 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms