Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RLBP1P12271 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms