Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ODC1P11926 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ODC1P11926 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ODC1P11926 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ODC1P11926 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ODC1P11926 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ODC1P11926 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ODC1P11926 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ODC1P11926 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ODC1P11926 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ODC1P11926 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ODC1P11926 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODC1P11926 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODC1P11926 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODC1P11926 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODC1P11926 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODC1P11926 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODC1P11926 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODC1P11926 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODC1P11926 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODC1P11926 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODC1P11926 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODC1P11926 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODC1P11926 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODC1P11926 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODC1P11926 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODC1P11926 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODC1P11926 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODC1P11926 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODC1P11926 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODC1P11926 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODC1P11926 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODC1P11926 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODC1P11926 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ODC1P11926 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODC1P11926 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODC1P11926 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODC1P11926 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODC1P11926 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODC1P11926 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODC1P11926 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODC1P11926 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODC1P11926 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODC1P11926 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODC1P11926 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODC1P11926 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODC1P11926 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODC1P11926 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODC1P11926 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODC1P11926 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ODC1P11926 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ODC1P11926 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODC1P11926 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODC1P11926 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODC1P11926 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODC1P11926 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODC1P11926 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODC1P11926 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODC1P11926 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODC1P11926 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODC1P11926 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODC1P11926 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODC1P11926 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODC1P11926 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODC1P11926 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODC1P11926 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODC1P11926 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ODC1P11926 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODC1P11926 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODC1P11926 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODC1P11926 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODC1P11926 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODC1P11926 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ODC1P11926 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODC1P11926 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODC1P11926 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODC1P11926 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODC1P11926 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms