Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP1P11387 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1P11387 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1P11387 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1P11387 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1P11387 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1P11387 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1P11387 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1P11387 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1P11387 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1P11387 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1P11387 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1P11387 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1P11387 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1P11387 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1P11387 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1P11387 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1P11387 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1P11387 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1P11387 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1P11387 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP1P11387 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1P11387 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1P11387 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1P11387 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1P11387 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1P11387 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1P11387 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1P11387 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1P11387 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1P11387 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1P11387 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1P11387 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP1P11387 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TOP1P11387 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TOP1P11387 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TOP1P11387 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP1P11387 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1P11387 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1P11387 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1P11387 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1P11387 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1P11387 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1P11387 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1P11387 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1P11387 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1P11387 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1P11387 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1P11387 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1P11387 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1P11387 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1P11387 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1P11387 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1P11387 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1P11387 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms