Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLUP10909 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLUP10909 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLUP10909 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLUP10909 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLUP10909 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLUP10909 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLUP10909 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLUP10909 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLUP10909 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLUP10909 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLUP10909 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUP10909 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLUP10909 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLUP10909 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLUP10909 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLUP10909 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLUP10909 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLUP10909 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLUP10909 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLUP10909 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLUP10909 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLUP10909 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLUP10909 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLUP10909 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLUP10909 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLUP10909 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLUP10909 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLUP10909 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLUP10909 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLUP10909 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLUP10909 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLUP10909 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLUP10909 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLUP10909 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLUP10909 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLUP10909 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLUP10909 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLUP10909 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLUP10909 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLUP10909 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLUP10909 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLUP10909 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLUP10909 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLUP10909 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLUP10909 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLUP10909 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLUP10909 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLUP10909 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUP10909 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUP10909 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUP10909 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUP10909 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUP10909 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUP10909 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUP10909 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUP10909 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUP10909 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUP10909 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUP10909 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUP10909 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUP10909 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUP10909 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUP10909 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUP10909 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUP10909 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUP10909 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUP10909 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLUP10909 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLUP10909 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLUP10909 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLUP10909 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLUP10909 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLUP10909 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLUP10909 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLUP10909 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLUP10909 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms