Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms