Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf88P0DMB2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms