Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTAP09496 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTAP09496 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTAP09496 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTAP09496 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTAP09496 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTAP09496 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTAP09496 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTAP09496 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTAP09496 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTAP09496 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTAP09496 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTAP09496 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTAP09496 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTAP09496 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTAP09496 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTAP09496 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTAP09496 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTAP09496 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTAP09496 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTAP09496 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTAP09496 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTAP09496 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTAP09496 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLTAP09496 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTAP09496 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTAP09496 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTAP09496 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTAP09496 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTAP09496 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTAP09496 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTAP09496 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTAP09496 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTAP09496 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTAP09496 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTAP09496 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTAP09496 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTAP09496 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTAP09496 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTAP09496 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTAP09496 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTAP09496 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTAP09496 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTAP09496 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTAP09496 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTAP09496 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTAP09496 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTAP09496 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTAP09496 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTAP09496 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTAP09496 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTAP09496 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTAP09496 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTAP09496 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTAP09496 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTAP09496 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTAP09496 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTAP09496 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTAP09496 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTAP09496 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTAP09496 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTAP09496 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTAP09496 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTAP09496 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTAP09496 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTAP09496 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTAP09496 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTAP09496 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTAP09496 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTAP09496 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTAP09496 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTAP09496 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTAP09496 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTAP09496 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTAP09496 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTAP09496 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms