Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP10P09238 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP10P09238 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP10P09238 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP10P09238 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP10P09238 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP10P09238 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP10P09238 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP10P09238 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP10P09238 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP10P09238 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP10P09238 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP10P09238 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP10P09238 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP10P09238 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP10P09238 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP10P09238 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP10P09238 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP10P09238 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP10P09238 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP10P09238 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP10P09238 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP10P09238 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP10P09238 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP10P09238 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP10P09238 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP10P09238 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP10P09238 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP10P09238 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP10P09238 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP10P09238 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP10P09238 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP10P09238 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP10P09238 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP10P09238 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP10P09238 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP10P09238 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MMP10P09238 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MMP10P09238 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP10P09238 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP10P09238 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP10P09238 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP10P09238 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP10P09238 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP10P09238 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP10P09238 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP10P09238 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP10P09238 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP10P09238 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP10P09238 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP10P09238 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP10P09238 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP10P09238 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP10P09238 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP10P09238 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP10P09238 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP10P09238 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP10P09238 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP10P09238 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP10P09238 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP10P09238 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP10P09238 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP10P09238 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP10P09238 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP10P09238 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP10P09238 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP10P09238 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP10P09238 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP10P09238 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP10P09238 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP10P09238 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP10P09238 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP10P09238 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP10P09238 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP10P09238 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP10P09238 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP10P09238 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP10P09238 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP10P09238 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP10P09238 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP10P09238 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP10P09238 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP10P09238 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP10P09238 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP10P09238 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP10P09238 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP10P09238 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP10P09238 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP10P09238 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP10P09238 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP10P09238 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP10P09238 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP10P09238 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP10P09238 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP10P09238 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP10P09238 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP10P09238 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP10P09238 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP10P09238 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP10P09238 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms